Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms