Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAAF4Q8WXU2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms