Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATL2Q8NHH9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms