Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL34Q8N239 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL34Q8N239 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms