Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC84Q86UT8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms