Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC73Q6ZRK6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC73Q6ZRK6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms