Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EFCAB12Q6NXP0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EFCAB12Q6NXP0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms