Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMBQ6NW40 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms