Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4Q6IC98 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms