Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOCADQ5VW36 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOCADQ5VW36 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms