Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RPRD2Q5VT52 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms