Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC183Q5T5S1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms