Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP55Q53EZ4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms