Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPRNQ4KMQ1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms