Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7S5

SMIM21, Small integral membrane protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM21Q3B7S5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM21Q3B7S5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM21Q3B7S5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms