Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CBFBQ13951 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBFBQ13951 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms