Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCINQ13939 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCINQ13939 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCINQ13939 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCINQ13939 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCINQ13939 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCINQ13939 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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