Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RUNX3Q13761 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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