Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME3Q13232 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME3Q13232 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME3Q13232 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME3Q13232 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME3Q13232 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME3Q13232 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME3Q13232 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME3Q13232 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME3Q13232 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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