Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
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