Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK2Q13002 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK2Q13002 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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