Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM27E3Q08E93 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms