Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL1Q08397 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms