Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GOLGA3Q08378 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms