Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms