Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP1-1Q07627 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms