Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCL9Q07325 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms