Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms