Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2BQ00403 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2BQ00403 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2BQ00403 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2BQ00403 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2BQ00403 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2BQ00403 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms