Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMF1P82094 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMF1P82094 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMF1P82094 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms