Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB3P54284 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms