Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSBP53539 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSBP53539 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSBP53539 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSBP53539 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms