Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBX1P52954 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBX1P52954 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBX1P52954 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBX1P52954 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBX1P52954 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBX1P52954 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBX1P52954 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LBX1P52954 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBX1P52954 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBX1P52954 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBX1P52954 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBX1P52954 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LBX1P52954 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LBX1P52954 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LBX1P52954 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LBX1P52954 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LBX1P52954 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBX1P52954 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBX1P52954 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBX1P52954 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBX1P52954 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBX1P52954 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBX1P52954 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms