Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2A2P52657 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2A2P52657 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms