Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRCA1P38398 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRCA1P38398 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms