Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE6BP35913 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE6BP35913 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms