Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDIT3P35638 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms