Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRMP28827 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
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