Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms