Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP2B4P23634 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B4P23634 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms