Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms