Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFTRP13569 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CFTRP13569 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFTRP13569 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFTRP13569 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFTRP13569 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFTRP13569 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFTRP13569 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFTRP13569 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFTRP13569 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFTRP13569 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFTRP13569 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFTRP13569 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFTRP13569 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFTRP13569 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CFTRP13569 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CFTRP13569 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFTRP13569 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFTRP13569 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFTRP13569 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFTRP13569 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
CFTRP13569 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFTRP13569 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFTRP13569 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFTRP13569 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFTRP13569 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFTRP13569 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFTRP13569 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFTRP13569 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFTRP13569 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFTRP13569 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFTRP13569 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFTRP13569 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFTRP13569 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFTRP13569 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFTRP13569 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFTRP13569 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFTRP13569 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFTRP13569 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFTRP13569 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFTRP13569 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CFTRP13569 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CFTRP13569 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFTRP13569 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFTRP13569 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFTRP13569 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFTRP13569 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFTRP13569 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CFTRP13569 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFTRP13569 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFTRP13569 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFTRP13569 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFTRP13569 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFTRP13569 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFTRP13569 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFTRP13569 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFTRP13569 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFTRP13569 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFTRP13569 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFTRP13569 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFTRP13569 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFTRP13569 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFTRP13569 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFTRP13569 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFTRP13569 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFTRP13569 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFTRP13569 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFTRP13569 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFTRP13569 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFTRP13569 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFTRP13569 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFTRP13569 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFTRP13569 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms