Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL11A1P12107 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL11A1P12107 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms