Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MMP3P08254 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MMP3P08254 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MMP3P08254 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MMP3P08254 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MMP3P08254 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP3P08254 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms