Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CBX7O95931 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBX7O95931 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBX7O95931 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBX7O95931 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms