Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX58O95786 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX58O95786 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX58O95786 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX58O95786 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX58O95786 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX58O95786 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX58O95786 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX58O95786 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX58O95786 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms