Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP19O94966 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP19O94966 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP19O94966 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP19O94966 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP19O94966 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP19O94966 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP19O94966 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP19O94966 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP19O94966 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP19O94966 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP19O94966 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP19O94966 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP19O94966 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP19O94966 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP19O94966 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP19O94966 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP19O94966 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP19O94966 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP19O94966 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP19O94966 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP19O94966 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP19O94966 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP19O94966 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP19O94966 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP19O94966 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP19O94966 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP19O94966 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
USP19O94966 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP19O94966 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP19O94966 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP19O94966 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP19O94966 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP19O94966 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP19O94966 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP19O94966 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP19O94966 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP19O94966 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP19O94966 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP19O94966 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP19O94966 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP19O94966 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP19O94966 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP19O94966 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP19O94966 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
USP19O94966 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
USP19O94966 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP19O94966 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP19O94966 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP19O94966 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP19O94966 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP19O94966 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP19O94966 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP19O94966 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP19O94966 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP19O94966 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP19O94966 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms