Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP2O75604 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP2O75604 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP2O75604 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP2O75604 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP2O75604 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP2O75604 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP2O75604 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP2O75604 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP2O75604 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP2O75604 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP2O75604 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP2O75604 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP2O75604 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP2O75604 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP2O75604 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP2O75604 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP2O75604 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP2O75604 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP2O75604 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP2O75604 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP2O75604 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP2O75604 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP2O75604 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP2O75604 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP2O75604 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP2O75604 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP2O75604 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP2O75604 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP2O75604 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP2O75604 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP2O75604 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP2O75604 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP2O75604 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP2O75604 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP2O75604 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP2O75604 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP2O75604 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP2O75604 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP2O75604 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP2O75604 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP2O75604 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP2O75604 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP2O75604 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP2O75604 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP2O75604 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP2O75604 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP2O75604 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP2O75604 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP2O75604 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP2O75604 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms