Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP5O75197 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP5O75197 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP5O75197 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP5O75197 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP5O75197 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP5O75197 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP5O75197 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP5O75197 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP5O75197 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP5O75197 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP5O75197 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP5O75197 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms