Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP10AO60312 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms